O Laboratório Sementes de Cogumelos possui sistema de Controle de Qualidade através de auditoria técnica com monitoramento constante dos níveis de contaminação em cada fase do processo de produção das sementes de cogumelos “spawn” ou micélio. 
 
O controle inicia-se desde a obtenção da matriz primária de cogumelos – no seu Banco de Germoplasma – até a produção das sementes de cogumelos propriamente dita.